На основании утверждённого Устава для рассмотрения основных научных, научно-организационных и кадровых вопросов в БЕН РАН создан Ученый совет.
В состав Ученого совета Библиотеки входят: работники БЕН РАН, имеющие ученую степень, и приглашенные внешние специалисты, компетентные в направлениях научных исследований, проводимых БЕН РАН, прошедшие процедуру выборов.
Функции Ученого совета отражены в Положении.